Z-DNA

Le Z-DNA est l'une des nombreuses doubles structures hélicoïdales possibles d'ADN . C'est une double structure hélicoïdale gauchère en laquelle la double spirale s'enroule vers la gauche dans un modèle en zig-zag (au lieu de vers le droit, comme la forme plus commune de B-DNA ). Z-DNA est vraisemblablement l'une de trois doubles structures hélicoïdales biologiquement actives avec le A et B-DNA.

Histoire

Z-DNA était la première structure cristalline d'une molécule d'ADN à résoudre (voir : Cristallographie de rayon X de ). Il a été résolu par le Alexandre riche et les collègues en 1979 au MIT . La cristallisation d'un b à la jonction de Z-DNA dans 2005 a fourni un meilleur arrangement des jeux potentiels du rôle Z-DNA en cellules. Toutes les fois qu'un segment de Z-DNA forme, il doit y avoir des jonctions du BZ à ses deux extrémités, le connectant à la B-forme d'ADN trouvée dans le reste du génome .

En 2007, la version de l'ARN de Z-DNA a été décrite comme version transformée d'une double spirale du A-RNA dans une spirale gauchère.

Structure

Z-DNA est très différent des formes droitières. En fait, Z-DNA est souvent comparé contre B-DNA afin d'illustrer les différences principales. La spirale de Z-DNA est gauchère et a une structure qui répète chaque 2 paires basses. Les cannelures principales et mineures, à la différence d'A et de B-DNA, montrent peu de différence dans la largeur. La formation de cette structure est généralement défavorable, bien que certaines conditions puissent la favoriser ; comme la purine alternative - l'ordre de la pyrimidine , ADN de supercoiling ou haut sel et quelques cations Z-DNA de peut former une jonction avec B-DNA dans une structure qui implique l'extrusion d'une paire basse.

Structure de prévision de Z-DNA

Il est possible de prévoir la probabilité d'un ordre d'ADN formant une structure de Z-DNA. Un algorithme pour prévoir la propension de l'ADN de renverser de la B-forme à la Z-forme, ZHunt , a été écrit par le Dr. Shing Ho en 1984 (au MIT). Cet algorithme plus tard a été développé par le camp de Tracy de , le champion du P. Christoph, le Sandor Maurice , et le Jeffrey M. Vargason pour la cartographie génome-large de Z-DNA (avec P. Shing Ho en tant qu'investigateur principal). Z-Chasser est disponible à Z-Chassent en ligne.

Signification biologique

Tandis qu'aucune signification biologique définitive de Z-DNA n'a été trouvée, on l'est censé généralement pour fournir le passe-fils de torsion ( supercoiling ) tandis que la transcription d'ADN se produit. Le potentiel de former une structure de Z-DNA se corrèle également avec des régions de la transcription active . Une comparaison des régions avec une propension ordre-dépendante et prévue élevée de former Z-DNA en chromosome humain de 22 avec un ensemble choisi d'emplacements connus de transcription de de gène suggère qu'il y ait une corrélation.

Z-DNA a formé après que le déclenchement de transcription dans certains cas puisse être lié par les enzymes de modification de RNA qui changent alors l'ordre de l'ARN récemment formé.

Les géométries de comparaison de quelques formes d'ADN

Random links: