Virus d\'usine
Les virus d'usine de sont les virus affectant les usines . Les virus d'usine, comme tous autres virus, sont obligent les parasites intracellulaires qui n'ont pas les machines moléculaires à replier sans centre serveur. Les virus d'usine sont définis comme virus pathogènes à de plus hautes usines alors que cet article ne prévoit pas pour énumérer tous les virus d'usine, il de discute quelques virus importants aussi bien que leurs utilisations dans la biologie moléculaire d'usine.
Vue d'ensemble
Des virus d'usine presque aussi bien ne sont pas compris comme contre-parties animales, ceci est tout ironique que le premier virus à découvrir (voir ci-dessous) était le virus de mosaïque du tabac (TMV) aussi bien que le fait qu'ils ont par an une influence US$60,000,000,000 économique prévue sur des récoltes dans le monde entier. Des virus d'usine sont groupés dans 73 genres et 49 familles.
Histoire
La découverte des virus d'usine causant la maladie est souvent accréditée au Martinus Beijerinck qui discoved, en 1898, cela même après passer la sève contagieuse d'arbre par un filtre de porcelaine est resté infectieux mais était stérile des micro-organismes .Après que la découverte initiale du concept viral de `' là ait été le besoin de classifier toutes les autres maladies virales connues du basées sur le mode de la transmission quoique l'observation microscopique du ait prouvé stérile. En Holmes 1939 édité une liste de classification de 129 virus d'usine. Ceci a été augmenté et en 1999 il y avait 977 officiellement identifiés, et un certain temporaire, espèces de virus d'usine.
La purification du TMV (la première purification) a été exécutée la première fois par le Wendell Stanley , qui a édité ses résultats en 1936. Il plus tard a été accrédité avec le prix Nobel en chimie en 1946. En quelques années 50. la découverte par deux laboratoires a simultanément montré que l'ARN purifié du TMV était infectieux ce qui a renforcé l'argument, qu'eu beaucoup d'opposition alors, que l'ARN diffusait l'information génétique du pour coder pour la production de nouvelles particules infectieuses.
Plus récemment la recherche a été concentrée sur la manipulation et la modification des génomes de virus d'usine découvrent la fonction et pour le gain commercial dans les affaires de l'agriculture en employant des ordres viral-dérivés pour fournir l'arrangement des formes originales de résistance. La perche récente en technologie permettant à des humains de manoeuvrer des virus d'usine a vraiment aidé à introduire le sujet hors d'un âge de la science d'Aristolean (observation et description des thèmes) et dans le 21ème centaury.
Structure
Les virus sont très petits et peuvent seulement être vus sous un microscope électronique . La structure d'un virus est donnée par son manteau des protéines , qui entourent le génome viral . L'Assemblée des particules virales a lieu le spontanément .
Plus de 50% de virus d'usine connus sont la tige formée (flexious ou rigide). La longueur exacte dépend normalement du génome mais elle est habituellement entre 300-500 le le nanomètre avec un diamètre de 15-20 nanomètre. Des sous-unités de protéine peuvent être placées autour de la circonférence d'un cercle pour former un disque. En présence du génome viral, les disques sont empilés, puis un tube est créé avec la pièce pour le génome de l'acide nucléique au milieu.
La deuxième structure commune parmi des virus d'usine sont les particules isométriques du . Elles ont 40-50 ans nanomètre de diamètre. Dans les cas quand il y a seulement une protéine simple de manteau, la structure de base se compose des sous-unités de 60 T, où T est un nombre entier . Quelques virus peuvent avoir 2 protéines de manteau sont la formation de la particule est analogue à un football .
Il y a trois genres de Geminiviridae de ce les particules géminées du de bandes qui sont comme deux particules isométriques du coincées ensemble.
Un nombre très petit de virus d'usine ont, en plus de leurs protéines de manteau, une enveloppe de lipide de . Ceci est dérivé de la membrane de cellules d'usine pendant que le de particules de virus bourgeonne au loin de la cellule .
Transmission des virus d'usine
Par la sève
Il implique le transfert direct de la sève par le contact de et l'usine blessée avec sain. Un tel processus se produit pendant des pratiques agricoles par des outils, mains, ou par l'affouragement animal sur l'usine. Généralement TMV, virus de pomme de terre et virus de mosaïque de concombre sont transmis par l'intermédiaire de la sève.
Insectes
Des virus d'usine doivent être transmis par un vecteur , le plus souvent les insectes de tel que les cicadelles . On a proposé une classe des virus, le Rhabdoviridae , pour être réellement des virus d'insecte qui ont évolué à la réplique aux usines. L'insecte vecteur choisi d'un virus d'usine sera souvent le facteur de détermination dans cette gamme du centre serveur des virus : il peut seulement infecter les usines que l'insecte vecteur alimente au moment. Ceci a été montré en partie quand la mouche blanche du Vieux Monde l'a fait au Etats-Unis , où il a transféré beaucoup de virus d'usine sur de nouveaux centres serveurs.
Selon la manière ils sont transmis, des virus d'usine sont classifiés comme non rémanents, semi-persistants et persistant. Dans la transmission non rémanente , les virus deviennent attachés au bout distal du Stylet de l'insecte et sur la prochaine usine qu'elle alimente dessus, il l'inocule avec le virus. la transmission virale Semi-persistante implique le virus écrivant le Foregut de l'insecte.
Ces virus qui parviennent à passer par l'intestin dans la hémolymphe et puis aux glandes salivaires sont connus comme persistant. Il y a deux sous-classes des virus persistants : propergative et circulatoire. Les virus de Propergative peuvent replier dans l'usine et l'insecte (et peuvent avoir à l'origine été les virus d'insecte), tandis que circulatoire ne peuvent pas.
Beaucoup de virus d'usine codent dans leurs polypeptides de génome avec des domaines essentiels pour la transmission par des insectes. Dans les virus non rémanents et semi-persistants, ces domaines sont en une protéine de manteau et une protéine différente connues sous le nom de composant d'aide. On a proposé une hypothèse traversière pour expliquer comment aide de ces protéines par transmission virale insecte-négociée. Le composant d'aide liera au domaine spécifique de la protéine de manteau, et puis aux trompes d'insecte - création d'un pont.
Dans les virus propergative persistants, tels que la tomate de repérée se fanent le virus (TSWV), il y a souvent un manteau de lipide entourant les protéines qui n'est pas vu dans les autres classes des virus d'usine. Dans le cas de TSWV, 2 protéines virales sont exprimées en cette enveloppe de lipide. On lui a proposé que les virus lient par l'intermédiaire de ces protéines et soient puis pris dans la cellule d'insecte par le récepteur-négocié Endocytosis .
Nématodes
les nématodes de Sol-Bourne également ont été montrés pour transmettre des virus. Ils les acquièrent et transmettent par l'alimentation sur les racines infectées de que des virus de peuvent être transmis par non-persistently et constamment, mais il n'y a aucune évidence des virus pouvant replier dans les nématodes.
Plasmodiophorids
Un certain nombre de genra viral sont transmis, constamment et non-persistently, par les protozoaires zoosporic du de Bourne de sol. Ces protozoaires ne sont pas phytopathogéniques eux-mêmes, mais parasite. La transmission du virus a lieu quand ils deviennent associés aux racines d'usine.
Un exemple est les graminis de Polymyxa de , qui a été montré pour transmettre les maladies virales d'une usine dans les récoltes ceral.
Graine et virus soutenus par pollen
La transmission de virus d'usine de la génération à la génération se produit dans environ 20% de virus d'usine. Quand des virus sont transmis par des graines, la graine est infectée dans les cellules génératives et le virus est maintenu dans les cellules germinales et parfois, mais moins souvent, dans l'écale du grain. Quand la croissance et le développement des usines est retardée en raison des situations comme le temps défavorable, il y a une augmentation de la quantité d'infections de virus en graines. Il ne semble pas y a une corrélation entre l'endroit de la graine sur l'usine et ses possibilités de l'infection. peu est connu au sujet des mécanismes impliqués dans la transmission des virus d'usine par l'intermédiaire des graines, bien qu'on le sache qu'on l'influence ambiant et que la transmission de graine se produit en raison d'une invasion directe de l'embryon par l'intermédiaire de l'ovule ou par un itinéraire indirect avec une attaque sur l'embryon négocié par les gamètes infectées. ces processus peut se produire concurremment ou séparément selon l'usine de centre serveur. Il est inconnu comment le virus peut directement envahir et croiser l'embryon et la frontière entre les générations parentales et de progéniture dans l'ovule. Beaucoup d'espèces d'usines peuvent être infectées par des graines incluant mais ne pas être limitées aux familles Leguminoseae, Solanacease, Compositae, Rosaceae, Curcurbitaceae, Gramineae.
Traduction des protéines virales d'usine
Comme mentionné ci-dessus, 90% de virus d'usine ont des génomes qui se composent de l'ARN échoué simple, signifiant qu'ils sont dans la même orientation de sens que l'ARN de messager . Les virus utilisent les ribosomes d'usine pour produire les 4-10 protéines codées par leur génome. Cependant, puisque toutes les protéines sont codées sur une rive simple (c'est-à-dire, elles sont Ploycistronic ) que ceci signifiera que le ribosome ou produira seulement une protéine, car il terminera la traduction au premier codon non-sens ou qu'un Polyprotein sera produit. Les virus d'usine ont dû évoluer des techniques spéciales pour permettre la production des protéines virales par les cellules d'usine de
' chapeau 5
Afin de la traduction à se produire les mRNAs eucaryotiques du structure du chapeau exiger 5 '. Ceci signifie que les virus doivent également avoir un. Ceci se compose normalement de 7MeGpppN où N est normalement l'adénine ou la guanine . Les virus codent une protéine, normalement un Replicase , avec une activité de Methyltransferase pour permettre ceci.
Quelques virus sont des chapeau-snatchers. Pendant ce processus, un centre serveur ADN messagère de 7mG-capped est recruté par le transcriptase viral complexe et plus tard fendu par une ribonucléase virally codée. L'ARN couvert en résultant de chef est employé pour amorcer la transcription sur le génome viral.
Toutefois quelques virus d'usine n'utilisent pas le chapeau, pourtant traduisent efficacement en raison des renforceurs chapeau-indépendants de traduction actuels dans 5 ' et 3 ' régions non traduites d'ADN messagère virale
Production de RNAs secondaire-genomic
Quelques virus emploient la production du Secondaire-genomic RNAs pour assurer la traduction de toutes les protéines dans leurs génomes. Dans ce processus la première protéine codée sur le génome, et ceci la première à traduire, est un replicase . Cette protéine agira du reste du génome produisant la rive négative RNAs secondaire-genomic puis agit sur ces derniers de former la rive positive RNAs secondaire-genomic qui sont essentiellement des mRNAs prêts pour la traduction.
Génomes segmentés
Quelques familles viraux, tels que le Bromoviridae de choisissent à la place d'avoir les génomes pluripartistes du , génomes dédoublés entre les particules virales multiples. Pour que l'infection se produise, l'usine doit être atteinte de toutes les particules à travers le génome. Par exemple le virus de mosaïque de Brome de a un génome dédoublé entre 3 particules virales, et chacune des 3 particules avec le RNAs différent est exigé pour l'infection pour avoir lieu.
Traitement de Polyprotein
Ce stratergy est adopté par genra viral tel que le Potyviridae et le Tymovirus . Le ribosome traduit une protéine simple du génome viral. Dans le polyprotein est un ezyme avec la fonction de la protéinase qui peut en mesure fendent le polyprotein dans les diverses protéines simples ou fend juste loin le replicase, qui peut alors produire RNAs secondaire-genomic.
Virus d'usine bien compris
Le virus de mosaïque du tabac (TMV) et le virus (CaMV) de mosaïque de chou-fleur de sont fréquemment employés dans la biologie moléculaire d'usine. D'intérêt spécial est l'instigateur de CaMV 35S, qui est un instigateur très fort plus souvent utilisé dans les transformations d'usine
Voir également
Virus Aphididae
Graphique électrique de pénétration de
Subgenomic
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