Prenylation

Le Prenylation ou l'isoprenylation ou le lipidation est l'addition des molécules hydrophobes du à une protéine . On le suppose habituellement que les groupes de prenyl facilitent l'attachement aux membranes de cellules de semblables à l'ancre de lipide de comme l'ancre du GPI, bien que l'évidence directe soit absente. Les groupes de Prenyl se sont avérés importants pour la protéine - protéine de liant par des domaines prenyl-contraignants spécialisés.

Prenylation de protéine

Le prenylation de protéine implique le transfert d'un farnesyl ou d'une partie géranylique-géranylique aux cystéines de C-borne de la protéine de cible. Il y a trois enzymes qui effectuent le prenylation dans la cellule.

Farnesyltransferase et geranylgeranyltransferase I

Le Farnesyltransferase et le Geranylgeranyltransferase I sont les protéines très semblables. Ils se composent de deux sous-unités, de la α-sous-unité qui est commune aux deux enzymes, et de la β-sous-unité dont l'identité d'ordre est juste 25%. Ces enzymes identifient la boîte de CaaX aux C-terminus de la protéine de cible. Le C est la cystéine qui prenylated, qu'un est n'importe quel acide aminé aliphatique, et l'identité du X détermine quelle enzyme agit sur la protéine. Le travail a indiqué dans la biologie de génome de de journal dans l'amélioration de 2005 rapports des méthodes de détection informatiques pour l'identification des motifs de prenylation de protéine et l'établissement d'un service en ligne d'analyse a eu droit le " ; PrePS" ;.

Transférase de geranylgeranyl de Rab

Le geranylgeranyltransferase de Rab, ou la transférase II de Geranylgeranyl, transfère (habituellement) deux groupes de geranylgeranyl aux cystéines aux C-terminus des protéines de Rab de . Le C-terminus des protéines de Rab varie dans la longueur et l'ordre et désigné sous le nom hypervariable. Ainsi les protéines de Rab n'ont pas une séquence consensus, telle que la boîte de CAAX, que la transférase de geranylgeranyl de Rab peut identifier. Au lieu de cela des protéines de Rab sont liées par la protéine (représentant) d'escorte de Rab de au-dessus d'une région plus conservée de la protéine de Rab et alors présentées au geranylgeranyltransferase de Rab. Une fois que des protéines de Rab prenylated les ancres de lipide s'assurent que Rabs ne sont plus soluble. Le représentant joue donc un rôle important en liant et en solubilisant les groupes de geranylgeranyl et livre la protéine de Rab à la membrane appropriée de cellules.

Le pyrophosphate (GGpp) de Geranylgeranyl de de chaînes d'isoprenoid et le pyrophosphate de Farnesyl de sont des produits de la voie de réductase de HMG-CoA de . Le produit de la réductase de HMG CoA est mevalonate. En combinant des précurseurs avec 5 carbones, la voie produit plus tard le pyrophosphate géranylique (10 carbones), le pyrophosphate de farnesyl (15 carbones) et le pyrophosphate de geranylgeranyl (20 carbones). Deux groupes de pyrophosphate de farnesyl peuvent également être combinés pour former le squalène, le précurseur pour le cholestérol ceci signifie que le Statins , qui empêche la réductase de HMG CoA, empêchent la production du cholestérol et des isoprenoids.

Noter que dans la voie de réductase/mevalonate de HMG-CoA les précurseurs contiennent déjà un groupe de pyrophosphate et des isoprenoids sont produits avec un groupe de pyrophosphate. Il n'y a aucun mécanisme connu pour ajouter un groupe de pyrophosphate à la forme d'alcool des isoprenoids ( Farnesol et Geranylgeraniol ), et il n'y a aucune activité enzymatique connue qui peut effectuer la réaction de prenylation à de l'alcool d'isprenoid. Néanmoins le farnesol s'est avéré capable sauver des effets provoqués par des statins, suggérant que le d'alcools puisse être impliqué dans le prenylation.

Les protéines qui subissent le prenylation incluent le Ras de , qui joue un rôle central dans le développement du Cancer . Ceci suggère que les inhibiteurs des enzymes de prenylation (par exemple Farnesyltransferase ) puissent influencer la croissance de tumeur. Les travaux récents ont l'exposition que les inhibiteurs (FTIs) de Farnesyltransferase de empêchent également le geranylgeranyltransferase de Rab et que le succès de tels inhibiteurs dans les tests cliniques peut être comme beaucoup dû aux effets sur le prenylation de Rab comme sur le prenylation de Ras .

Le FTIs peut également être employé pour empêcher le farnesylation dans les parasites tel que le brucii et la malaria de trypansoma de . Les parasites semblent être plus vulnérables à l'inhibition de la transférase de Farnesyl que les humains sont. Dans certains cas ceci peut se produire parce qu'ils manquent de Geranylgeranyltransferase I. Ainsi il peut être possible au développement des drogues antiparastic « ferroutage » sur le développement de FTIs pour la recherche sur le cancer. En outre FTIs ont montré une certaine promesse en traitant un modèle de souris de Progeria .

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