Intein

Un intein est un segment d'une protéine qui peut s'exciser et rejoindre les parties restantes (les exteins) avec un lien de peptide . Inteins se sont également appelés le " ; quot des introns de protéine ;.

La plupart des inteins rapportés contiennent également un domaine de la ribonucléase qui joue un rôle dans la propagation d'intein. En fait, beaucoup de gènes ont des segments indépendants d'intein-codage insérés à différentes positions. Ces derniers et d'autres raisons, des inteins (ou plus correctement, les segments de gène codant pour des inteins) sont parfois réclamés le les éléments génétiques égoïstes mais il peut être plus précis pour les appeler parasite. La différence est ce " ; genes" égoïste ; sont le " ; selfish" ; seulement pour autant que pour concurrencer d'autres gènes ou allèles mais accomplir toujours une fonction salutaire pour l'organization en général, tandis que " ; genes" parasite ; être functionless.

la protéine Intein-négociée de épissant se produit après que le ADN messagère ait été traduit en protéine. Cette protéine de précurseur contient trois segments - un N-extein suivi de l'intein suivi de C. Après l'épissure a eu lieu, le résultat s'appelle également un extein.

Le premier intein a été découvert dans le 1987 . Depuis lors, des inteins ont été trouvés dans chacun des trois domaines de la vie (eukaryotes, bactéries, et archaea). La connaissance concernant la situation évolutionnaire du des inteins et des éléments relatifs est passée en revue dans Gogarten et Hilario (2006). Le mécanisme pour l'effet de épissure est une analogie naturelle à la technique pour produire chimiquement des protéines moyennes appelées la ligature chimique indigène , qui a été développée en même temps que des inteins étaient découverts.

Inteins en biotechnologie

Inteins sont très efficace à la protéine épissant et ils ont en conséquence trouvé un rôle important en biotechnologie . Il y a plus de 200 inteins identifiés jusqu'ici, des tailles s'étendent de 100-800 aa. Inteins ont été machinés pour des applications particulières telles que la synthèse de protéine, et l'étiquetage sélectif des segments de protéine, qui est utile pour des études RMN du de grandes protéines.

L'inhibition pharmaceutique de l'excision d'intein peut être un outil utile pour le développement , la protéine de drogue de qui contient l'intein n'effectuera pas sa fonction normale si l'intein n'excise pas puisque sa structure sera perturbée.

On lui a suggéré que les inteins pourraient s'avérer utile pour réaliser l'expression d'Allotopic de de certaines protéines fortement hydrophobes normalement codés par le génome mitochondrique, par exemple dans la thérapie génique (de Grey 2000). Le hydrophobicity de ces protéines est un obstacle à leur importation dans les mitochondries . Par conséquent, l'insertion d'un intein non-hydrophobe peut permettre à cette importation de procéder. Excision de l'intein après que l'importation reconstitue alors la protéine au Sauvage-type .

Conventions de nomination d'Intein

La première partie d'un nom d'intein est basée sur le nom scientifique de l'organization dans laquelle on le trouve, et la deuxième partie est basée sur le nom du gène ou de l'extein correspondant. Par exemple, l'intein trouvé dans l'acidophilum de Thermoplasma de et lié « à la sous-unité vacuolaire A d'atpase » (VMA) s'appelle le « Tac VMA ».

Normalement, comme dans cet exemple, juste trois lettres suffisent pour spécifier l'organization, mais il y a des variations. Par exemple, des lettres additionnelles peuvent être ajoutées pour indiquer une contrainte. Si plus d'un intein est codé dans le gène correspondant, les inteins sont donnés un suffixe numérique à partir de 5 ' à 3 ' ou par ordre de leur identification. Par exemple, " ; Msm dnaB-1" ;.

Le segment du gène qui code l'intein est habituellement donné le même nom que l'intein, mais pour éviter la confusion, le nom de l'intein proprement dit est habituellement profité (par exemple Pfu RIR1-1), tandis que le nom du segment correspondant de gène est imprimé en italiques.

Pleins et mini inteins

Inteins peut contenir un domaine voyageur du gène de ribonucléase de en plus des domaines de épissure. Ce domaine est responsable de la diffusion de l'intein en fendant l'ADN à un allèle d'intein librement sur le chromosome homologue , déclenchant le système bicaténaire de la réparation (DSBR) de coupure d'ADN de , qui répare alors la coupure, de ce fait en copiant l'intein dans précédemment un intein situer librement. Le domaine de HEG n'est pas nécessaire pour l'intein épissant, et ainsi il peut être perdu, formant un intein minimal et ou mini. Plusieurs études ont démontré la nature modulaire des inteins en ajoutant ou en enlevant des domaines de HEG et en déterminant l'activité de la nouvelle construction.

Inteins fendus

Parfois, l'intein de la protéine de précurseur vient de deux gènes. Dans ce cas-ci, l'intein serait un intein de fente. Par exemple, dans le Cyanobacteria , le DnaE , l'alpha catalytique de sous-unité de l'ADN polymérase III, est codé par deux gènes séparés, dnaE-n et dnaE-c. Le produit de dnaE-n se compose d'un ordre de N-extein suivi d'un ordre d'intein de 123 aa (acide aminé), tandis que le produit de dnaE-c se compose d'un ordre d'intein de 36 aa suivi de C.

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