Emplacement de CpG
Les emplacements de CpG de sont des régions d'ADN où un nucléotide de la cytosine se produit à côté d'un nucléotide de la guanine dans l'ordre linéaire des bases sur sa longueur. " ; CpG" ; les stands pour la cytosine et la guanine ont séparé par un phosphate , qui lie les deux nucléosides ensemble en ADN. Le " ; CpG" ; la notation est employée pour distinguer une cytosine suivie de la guanine d'un appareillé par base de cytosine à une guanine.
Cytosines dans des dinucléotides de CpG sont méthylés par les methyltransferases DNA dans beaucoup d'organizations eucaryotiques pour former le methylcytosine du 5. Il peut noter que les mammifères méthylent 70%-80% de cytosines de CpG.
Fréquence dans les vertébrés
On a longtemps observé des dinucléotides de CpG pour se produire avec une fréquence beaucoup inférieure dans l'ordre des génomes vertébrés qu'être dû prévu à la chance aléatoire. Par exemple, dans un génome avec le contenu de CHROMATOGRAPHIE GAZEUSE de de 42% (comme le génome humain), on s'attendrait à ce qu'une paire de nucléotides se composant de la cytosine suivie de la guanine se produise 0. La fréquence des dinucléotides de CpG en génomes humains est &mdash de 1% ; plus moins d'un quart de la fréquence prévue. Le et autres de Scarano a proposé que l'insuffisance de CpG soit due à une plus grande vulnérabilité des methylcytosines de la mutation de transition de en génomes avec la méthylation de cytosine de CpG.
Îles de CpG
Il y a des régions de l'ADN qui ont une concentration plus élevée des emplacements de CpG, connues sous le nom d'îles de CpG de que beaucoup de gènes en génomes mammifères ont des îles de CpG se sont associés au début du gène. Pour cette raison, la présence d'une île de CpG est employée pour aider dans la prévision et l'annotation des gènes. Ces plus grandes concentrations de CpGs pourraient être associées à la méthylation diminuée des cytosines souvent observés dans le &mdash d'îles de CpG ; ceci a pu avoir comme conséquence une vulnérabilité réduite aux mutations de transition et, par conséquent, une densité plus élevée d'équilibre de CpGs survivant.
Méthylation, amortissement, et cancer
La méthylation des emplacements de CpG chez les instigateurs des gènes peut mener à leur amortissement, un dispositif trouvé dans un certain nombre de cancers humains (par exemple l'amortissement de gènes suppresseurs de tumeur . En revanche, le hypomethylation des emplacements de CpG a été associé à l'over-expression des Oncogenes dans des cellules cancéreuses.
Voir également TLR 9 de
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