EcoRI
ECOR1_Crystal_Structure.png|pouce|Structure cristalline d'EcoRI]]
Eco RI (" prononcé de ; one" de l'eco R ;) est une enzyme de la nucléase d'isolement dans certaines contraintes de Escherichia coli de , et fait partie du système de modification de restriction de .
Dans la biologie moléculaire , c'est une enzyme utilisée généralement de restriction de . Il crée les extrémités cohésives surplombs avec du 5 des ' fin . L'ordre d'acide nucléique où les coupes d'enzymes est G|AATTC, qui est un Palindrome car l'ordre complémentaire est CTTAA|G.
Structure
Structure primaire
EcoRI contient le palladium. Le motif de D/EXK dans son emplacement actif aiment beaucoup de ribonucléases de restriction de . Dans EcoRI ce motif se compose des résidus P90, D91, E111, A112, K113 (2).
Structure tertiaire et quaternaire
L'enzyme se compose d'un domaine globulaire de l'architecture de α/β. Elle également contient une boucle qui colle dehors du domaine simple et l'enroule autour de l'ADN quand la limite (3).
EcoRI cocrystallized avec l'ordre il normalement des coupes. Ce cristal a été employé pour résoudre la structure du complexe. La structure cristalline résolue montre aux formes d'enzymes un Homodimer quand elle lie l'ADN où les deux sous-unités agissent l'un sur l'autre avec de l'ADN symétriquement (3). Dans le complexe, deux α-spirales de chaque sous-unité viennent ensemble pour former un paquet de quatre spirales (2). Sur les spirales de interaction sont les résidus Glu144 et Arg145 qu'interactif ensemble la formation d'un anneau d'interférence permettant l'active situe pour communiquer (4).
Utilisations
En raison de leur capacité de couper l'ADN dans des endroits prévisibles et de laisser les extrémités qui peuvent être ligaturées en arrière ensemble, elles sont utilisées généralement dans le clonage , le criblage d'ADN, la mutagénèse de suppression, et beaucoup d'autres techniques utilisées généralement. EcoRI est à activité encline d'étoile de d'objet exposé si l'excès des sels sont présent pendant la digestion.
Voir également
EcoRV , une autre enzyme de
nucléase de d'Escherichia coli de .
FokI , une autre enzyme de nucléase de d'okeanokoites de flavobactérie de
.
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